且说黄帝轩辕游历人族，寻求证道机缘，他在游历途中，见人族生病后按地皇神农《神农本草经》记载用药，可是有些人却在用药后好无好转迹象，有的反而愈加严重，轩辕经过多方观察，纵欲发现了原因，原来人族虽然按照《神农本草经》用药，可是却不知辩证，只是按经验用药，有时候是寒症却用了治疗热症的要，有时当通却用泻药，这样以来，自然疗效不佳。
轩辕见此，决心要解决此事，于是回到陈都，召集众臣之中对医药养生比较有心得的岐伯、伯高、少师、少腧、腧跗、鬼舆、封距等人合力解决此事，这几人都是在养生之道上有独到见解的人，给了黄帝很多意见，让黄帝收获良多，黄帝又亲上雷泽，求见伏羲之父雷神，求取养道全真及人体经络之法，雷泽神自是倾囊相授。
此经八十一年，轩辕终于编撰完成了人族第一部医学养生经典《黄帝内经》，在此书之中，黄帝不仅论治病救人之道，而且还论述了养道全形之法，包罗万象，书成之日，只见天降功德，比之当初神农完成神农本草经亦是不遑多让，黄帝得此功德之助，修为更进一步，只待将黄帝内经传遍人族，便可功德圆满，证得圣皇道果。
在众臣的帮助下，黄帝快速将《黄帝内经》传遍人族，而黄帝轩辕在人族的威望亦是达到了顶点，黄帝轩辕见此，知道自己证道之日已近，于是命人在陈都外修建祭台，祭台建成之日，轩辕又焚香躬亲诸天圣人。
这一日，陈都外人山人海，因为今日便是人族共主轩辕证道之日，洪荒人族经历过天皇伏羲及地皇神农之事，对此事已经习惯，而且黄帝功德无量，洪荒人族亦是为他而高兴，故此今日前来为其祝贺送行。
待到日上中天，轩辕黄帝率领群臣登上祭台，周围人族尽皆高呼人皇圣德，待到轩辕在祭台上站定，只见紫气东来三千里，祥瑞漫天，天空中异香阵阵，却是新进圣人仓颉前来，众人参见，不一会儿，异象再起，地道圣人后土，人道圣人女娲，人教教主五行，魔教教主千煞，五庄观与世同君镇元子，紫微宫紫薇圣人等悉数到来，只是三清圣人，西方二圣却不曾到来，众圣亦是知道原因，因此时辰一到，五行便吩咐轩辕大典开始。
这是人教大弟子行真子走出，张开一道法旨念道：“兹尔人族共主轩辕，自接位人族共主以来，立百官，兴文字，创法度，丽九天而垂象；教稼穑，工算数，昭万世以腾文。大勋缨垂旷典，华盖络结祥云。下拯黎庶，上符昊命；恺乐九垓，泽被八纮，复又诛蚩尤，人族免于奴役，编经典，人族因之得以存命，功莫大焉，今受人教混沌无极太上教主五行道尊，人道混沌太上圣人圣母女娲娘娘法旨，封为人族人皇，享圣皇道果，居三十三天外三皇天，尔其钦哉。”
行真子一念完，那道法旨便化为一道紫气鸿蒙的大道道基，莫入轩辕头顶，随即只见天空一声巨响，天降功德，这却是轩辕直立人族的功德，其中六成落入轩辕头顶，只见轩辕气势一路飙升，不过片刻，紫气东来三千里，一股巨大的威压自轩辕身上升起，瞬间向整个洪荒压去，洪荒之中凡大罗金仙以下，尽皆跪在地上，口称圣人慈悲。即使是大罗金仙以上的准圣，也在这股气势的压迫下弯下了腰，向着陈都行了一礼。
余下的功德由辅佐轩辕的众人共享，皆得到不少好处。
轩辕证道，只见天空之中九条巨龙拉着一辆巨大的撵车缓缓而来，天皇伏羲与地皇神农自车中走出，先向众圣行了一礼，而后对轩辕说道：“皇弟，此时不归位，更待何时？”
轩辕呵呵一笑道：“多谢两位皇兄前来迎接。”当下飞身进入车中，五行见此，衣袖一挥，那轩辕众臣凡修为有成的，除了人教弟子之外，尽皆不由自主的飞起，随着三皇往三皇天飞去。
大典既罢，五行便吩咐一众人教弟子，即刻起各归道场，非法旨不得再插手人族事物。而后对众圣说道：“我等好不容易相聚，不如前往我那五行山，论道一番如何？”
众圣自是称善，往五行山而去。
且不说五行与众圣论道，那人族在轩辕离去后，并未指定谁来继位共主之位，后人族因见黄帝轩辕之孙颛顼贤，便推为共主，颛顼乃是阐教大弟子广成子的弟子，即位后立五官，严格遵循黄帝的政策行事，使社会安定太平。又有各种措施增强人族实力，功德亦是不小，但是却在广成子的蛊惑下刻意抹除人教痕迹，到了后期，又见九黎部落虽然归附人族，却仍然信奉巫族祖巫和人教教主，不敬三清，于是在广成子设计下假娶九黎供奉九凤大巫，却在婚礼上使用盗来的左道宗师盘王的蚀巫丹将九凤毒害，被九凤拼死一击而重伤，好在有治理人族的功德，虽然没有殒命，却修为尽失，最后被三皇接往三皇天，成为三皇五帝之中唯一一个毫无修为的圣帝。
颛顼之后，喾、尧、舜先后为人族共主，皆有大功德于人族，因此虽然并没如三皇那般成就圣人道果，可是却也达到了至人巅峰，又有功德相助，即使是圣人也要礼敬三分。不过由于三帝皆是三清门下，故此在位期间皆尽力抹除人教痕迹，因此慢慢的除了三皇时期便存在的人族外，新生的人族已经很少知道人教之事了。
到了舜帝后期，由于妖族之中出现了一个大妖，这大妖乃是洪荒四大灵猴之意的赤尻马猴，修为高绝，已然有了准圣初期实力，聚集了一大批没有躲入北俱芦洲的妖族，在人族为祸，更是搅动黄河与淮河之水，使得水淹洪荒，三教弟子虽然不乏准圣，但是却不及这赤尻马猴天生神通，尤其是这赤尻马猴一旦不敌，便躲入水中，他在水中神通大涨，三教门下准圣竟然不能制，使得大水淹没人族之地。
舜帝无法，命大贤鲧前去治水，鲧治水之初以堵为法，取得了不小的成果，可是此次洪水乃是妖族为祸，尤其是能够堵得住的，因此不久后，鲧便发现洪水反而愈发厉害，这时洪荒人族遭此大祸，尽皆前往陈都见瞬，请求舜帝治水，面对民情激愤，舜帝无法，只得斩杀鲧来平息民愤。
就在舜帝要斩杀鲧之前，五行山那已经将近万年未曾打开的山门却是打开了，一个身穿红色道袍，满头红发，浑身散发出一股股潇洒飘逸却又混沌古远的气势随着接引的行真子往山上走去。