《钢铁侠3》刚开始的剧情发生在林天祥还很年轻的时候。

他在一个学术交流会议上认识了一名女植物学家李雅。

她发现了一种绝境病毒，这种病毒能够通过改变植物基因让其快速修复自身。

同时也有可能运用到人体身上，实现残肢重生。

李雅想要找林天祥谈论学术，而林天祥却想和她探讨一下人生。

因此还放了一个自己狂热粉丝雷齐的鸽子，让其独自一人在天台吹了一晚上的冷风。

而后时间回到复仇者联盟里的纽约大战后。

林天祥因为几次面对外星人的失利而患上了火力不足焦虑症。

一心一意的扑在改进钢铁装甲上。

完全忽视了自己的女友兼公司管家的张维薇。

经过林天祥的研究，他成功将自己的钢铁装甲升级到了Mark42。

这套装甲具有远程操控和自行组装的能力。

与此同时，林天祥所在的城市周围还出现了一名叫林曼的恐怖分子。

到处杀害平民且制造恐怖袭击。

并扬言要拿掉阿美莉卡总统的脑袋。

那个被林天祥放了鸽子的瘸腿男人雷齐也出现了。

这次他全身健全，一点也看不出残疾的迹象。

他找到张维薇，向其展示了基因编辑技术。

想要和狂澜集团合作开发，推广市场，但被拒绝了。

林天祥的别墅里，张维薇向林天祥抱怨七夕都找不到人，还用mark42这么一个机器人来糊弄自己。

林天祥则表示自己心里很乱。

自从纽约大战后他发现自己只是一个躲在钢铁壳子里的普通人。

没有了钢铁装甲，他不是复仇者联盟里任何一个人的对手。

黑寡妇娜塔莎都比自己强。

陷入了深深的自我怀疑。

虽然女友的安慰让他暂时安心了不少，但在当晚就做噩梦召唤了Mark42。

突然出现的钢铁战甲吓了张维薇一跳，她当场表示不想过这种担惊受怕的生活。

不久后，林天祥的手下发现林曼的手下和一个人交易了特殊物品，不久后这个人就发生了爆炸。

手下也因此身受重伤。